رمزگشایی تاثیرات جهش های شایع پروتئین پریون انسانی از طریق مدلسازی مولکولی
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس
- نویسنده اسماعیل بهمرد
- استاد راهنما پرویز عبدالمالکی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1390
چکیده
جهش نقطهای در ژن پروتئین پریون انسانی، منجر به جایگزینی اسیدآمینه با اسیدآمینه دیگر شده که این جایگزینی در تبدیل شکل طبیعی به غیر طبیعی، تشکیل فیبرهای آمیلوئیدی و در نتیجه بیماریهایی پریونی مانند gss, cjd, vcjd, ffi دخیل میباشد. ما تاثیر جهشهای شایعی مانند s198f، i210v، n202d، r217q بر روی پروتئین پریون انسانی را بوسیله مقایسه مدلهای موتانت با مدل طبیعی بررسی کردهایم. آنالیزهای ساختاری مدلها بوسیله روشهای مولکولار مدلینگ و شبیه سازی دینامیک مولکولی انجام شد. مطابق نتایج بدست آمده، اغلب جهشها در نواحی نسبتا حفاظت شده و نواحی با حفاظت بالا اتفاق افتاده بود. بیشترین نوسانات بدست آمده ازآنالیز نتایج شبیه سازی دینامیکی مربوط به هلیکس a یعنی در حدود ناحیه رزیدوهای 152-144 و در انتهای کربوکسیلی هلیکس b در ناحیه دور از جایگاه جهشهای مورد بررسی میباشد. آنالیزهای ما از نتایج بدست آمده از شبیه سازی دینامیک مولکولی بوضوح نشان دهنده نقش تاثیرگذار و مهم اینترکشنهای دوربرد در نوسانهای ساختاری موتانت پروتئین پریون انسانی میباشد. نتایج بدست آمده از مولکولار مدلینگ مثل حذف و اضافه شدن پیوندهای هیدروژنی نشان میدهد جهشهای نقطهای ممکن است تاثیرات موضعی بر اینترکشنهای پروتئینی مورد نیاز برای الیگومریزاسیون فیبریلاری داشته باشند.
منابع مشابه
بررسی مولکولی و آنالیز بیوانفورماتیکی دو جهش شایع ژن فنیلآلانین هیدروکسیلاز(PAH) با روش HRM
سابقه و هدف: بیماری فنیلکتونوری شایعترین خطای مادرزادی متابولیسم آمینواسید در جهان است و نرخ بروز آن در ایران در حال افزایش است. هدف از مطالعه حاضر، بررسی کارایی روش HRM به عنوان روشی سریع و مناسب در شناسایی جهشهای شایع ژن فنیلآلانین هیدروکسیلاز منجمله IVS10-11G>A و P281L میباشد، تا با کمک به تشخیص زود هنگام این بیماری بتوان از بروز علائم آن جلوگیری کرد. مواد و روشها: در این مطالعه مورد-ش...
متن کاملبررسی تأثیر تغییرات درجه ی حرارت بر کنفورماسیون پروتئین پریون انسانی به روش شبیه سازی دینامیک مولکولی
زمینه و هدف: بیماری های پریونی گروهی از اختلالات تحلیل برنده دستگاه عصبی بوده که منجر به مرگ بیمار می شوند. این بیماری ها تبدیل پروتئین پریون سلولی طبیعی (prpc) به ایزوفرم غیرطبیعی آن با صفحات بتای فراوان (prpsc)، تشکیل و تجمع رشته های آمیلوییدی با مکانیسمی ناشناخته در سلول های عصبی را به دنبال دارند. هدف از این مطالعه، بررسی تأثیر افزایش یا کاهش موضعی درجه حرارت بر این فرآیند تبدیل می باشد. مو...
متن کاملمدلسازی به روش هومولوژی و شبیه سازی دینامیک مولکولی پروتئین Rab23 انسانی به هدف انجام مطالعات Docking با لیگاند کلسترول
Rab23 یکی از پروتئینهای خانواده Rab می باشد که مسوول تنظیم ادغام و اتصال غشاء ویزیکولها با اندامکهای سلولهای یوکاریوتی می باشد. این پروتئین یک تنظیم کننده منفی خودکار سلولی برای علامت دهی(Signaling) hedgehog در مهره داران است. مسیر علامت دهی hedgehog در رشد اکثر ارگانها و بافتهای مهره داران نقش محوری داشته و ارتباط آن با نقایص مادرزادی و بسیاری از انواع تومورها مشخص شده است. بنابراین دخا...
متن کاملارزیابی بیوانفورماتیکی پلیمورفیسمهای تک نوکلئوتیدی غیر مترادف (nsSNPs) بیماریزا در ناحیه کدکننده ژن پروتئین پریون انسانی (PRNP)
زمینه و هدف: پلیمورفیسمهای تک نوکلئوتیدی عامل ایجاد تنوع ژنتیکی در جانداران میباشند و در این میان، پلیمورفیسمهای تک نوکلئوتیدی غیر مترادف (nsSNPs) باعث تغییر در باقیماندههای اسیدآمینه میشوند. تحقیق اخیر با هدف بررسی احتمال ارتباط بین تمامی چندشکلیهای گزارششده از ژن پریون انسانی و بروز بیماری انجامشده است. مواد و روشها: در این مطالعه توالی اسیدآمینه ایزوفرم اصلی ژن پروتئین پریون انسان...
متن کاملمدلسازی جزء آلفای پروتئین G انسانی و نتایج آن در مطالعه تداخل این پروتئین با گیرنده های غشایی
متن کامل
ارزیابی موارد شایع هموگلوبینوپاتی در ایران از دیدگاه مولکولی
چکیده: زمینه و هدف: ژن عامل وراثتی و تعیین کننده یک عمل بیولوژیک، یک واحد توارث است که در یک قسمت ثابت کروموزوم واقع گردیده است. هموگلوبین (Hb(پروتئین آهن داری است که از دو جفت زنجیره پلی پپتیدی ) گلوبین( و چهار گروه پروستتیک هم، تشکیل شده است که هر کدام حاوی یک اتم آهن ظرفیتی )ferrous (میباشند. دو گروه ژن به ترتیب روی کروموزوم های شماره 9 و قرار دارند. در هموگلوبینوپاتی ها، ساختار یکی از چهار ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023